船队在茫茫的太平洋上航行，虽然一路上风平浪静，减少了人们不少痛苦，但食物又成了严重的问题。起初，船员们还可以借面包屑充饥，尽管这些面包屑已经发霉，长了蛆虫，又掺杂了强烈的老鼠尿的臭味，简直很难入口，但无论如何总还能维持生命，不致饿死。淡水固然也不新鲜了，已经变质发臭，但总还能供给人们身体一点水分，不致渴死。到后来，连这些东西也没有了，情况变得非常严重。总不见得就这样饿死吧！还是得想办法找点儿能充饥的东西。可是找来找去，实在是一点儿可吃的东西也找不到。有人说，牛皮不是也可以吃吗？这个提议，给人们带来了新的希望。的确，牛皮也可以充饥，船上还有一些牛皮。可是，这些牛皮硬得像石头一样，怎么能吃得下去呢？经过一阵议论，总算有了办法，把它放在海水里浸泡，几天后，再把它放在炭火上烘烤，这才勉强解决了濒于饿死的危险。偶尔捉到几只老鼠，那算是高级食物了。吃的问题虽然暂时解决了，但是，由于长期缺乏新鲜食物，许多人的牙床肿得连东西都不能吃，还是死了。
幸运活下来的人，体质也已衰弱到不支的地步。而面对茫茫的大洋，何时才能航到尽头？有人不得不又提出返回西班牙的建议。但是，麦哲伦坚定地回答说：“即使船上的牛皮统统吃光了，我们还是要前进。”
人们疲惫地继续向西航行。1521年1月24日，终于在远方看到了一块陆地，所有的人都异常兴奋。可是驶近一看，却大失所望，原来是一个环状的珊瑚小岛，就是现在的圣巴拉夫岛，岛上一片荒凉，什么也没有。人们只得带着失望的心情离去。过了11天，2月4日，又在远方瞧见了一块陆地，再一次激起了水手们的希望。但这一次也没有让大家得到什么，因为这个叫阿库尔的小岛，也是满目荒芜。
到3月5日，连牛皮也吃光了。甲板上并排躺着衰弱到了极点的人们，只有少数几个强壮、精力饱满的水手，仍然坚持着值班、瞭望。他们多么盼望陆地的出现呵！
第二天，3月6日，果然又见到陆地了，瞭望人员突然发出了震耳的喊声：“见到海岸了！见到海岸了！”
这一回，总不见得又是荒凉的小岛吧！每个人都热烈地渴望能弄到一点吃的东西。人们怀着希望向前驶去，不久，就看清了这是个有人居住的岛屿，而且岛屿不止一个，有一群。(www.zuozong.com)
过着原始公社生活的岛民们，对突而其来的三艘大船很觉新奇，纷纷跑来观看。他们不知道什么是私有，一切东西大家随便享用。他们把许多食物送给这些不速之客，也去到船上，随便拿走他们认为新奇的东西。这些举动，对岛上居民来说是极其自然的，但对生活在私有制度下的船员则无法理解。因此，这些欧洲人就把岛民们污蔑为“强盗”，把这群岛屿叫作“强盗群岛”。污蔑之词当然是要推翻的，后来，“强盗群岛”的名字便为“马利亚纳群岛”所代替，并且沿用下来。
3月8日，舰队来到了菲律宾群岛中的胡穆奴岛。这是一个丛林密布、植物繁茂的热带岛屿，香蕉、椰子之类的果实到处皆是。于是，麦哲伦决定在这里作短暂停留，让船员们进行一次休整。
过了半个多月，3月25日，舰队离开胡穆奴岛。航行了三天，于3月28日到达马索华岛。这时，一个奇怪的现象引起了麦哲伦的注意，他带来的马六甲随从亨利，竟然能和这里的居民交谈！麦哲伦才恍然大悟，原来他已经来到东方了，已经来到了说马来语的世界，他的目的基本上达到了，他所寻找的香料群岛一定就在不远的地方。其实，他要寻找的香料群岛——马鲁古群岛早已驶过，由于航线偏北，他已来到了马鲁古群岛西北的菲律宾群岛了。
于是，麦哲伦一行便在群岛中穿行，结交了一些朋友，也残杀了不少岛民，并且卷入了部族之间的争斗。在一次战斗中，麦哲伦被射向他的标枪击中身亡，许多船员也被杀害。
剩下的113人，不够应付三艘船的工作，况且，“康塞普逊”号也已损坏，便烧了它，驾着两艘船去寻找香料群岛。
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